Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc130Q9D516 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms