Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930578G10RikQ9D4Q4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930578G10RikQ9D4Q4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms