Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Phf6Q9D4J7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Phf6Q9D4J7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms