Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc71Q9D3W5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lrrc71Q9D3W5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc71Q9D3W5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms