Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rsph14Q9D3W1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rsph14Q9D3W1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rsph14Q9D3W1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms