Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stag1Q9D3E6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stag1Q9D3E6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stag1Q9D3E6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms