Protein–RNA interactions for Protein: Q9D311

Duoxa2, Dual oxidase maturation factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Duoxa2Q9D311 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Duoxa2Q9D311 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Duoxa2Q9D311 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms