Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Batf3Q9D275 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Batf3Q9D275 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms