Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K2

Atp6v1f, V-type proton ATPase subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1fQ9D1K2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp6v1fQ9D1K2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v1fQ9D1K2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms