Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Necap2Q9D1J1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Necap2Q9D1J1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Necap2Q9D1J1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms