Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab1bQ9D1G1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab1bQ9D1G1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab1bQ9D1G1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms