Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf2e1Q9D0D5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2e1Q9D0D5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms