Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl55Q9CZ83 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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