Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snf8Q9CZ28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms