Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gins3Q9CY94 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins3Q9CY94 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms