Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smyd3Q9CWR2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smyd3Q9CWR2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms