Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smurf1Q9CUN6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smurf1Q9CUN6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smurf1Q9CUN6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms