Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Six6os1Q9CTN5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Six6os1Q9CTN5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Six6os1Q9CTN5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms