Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rprd1bQ9CSU0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rprd1bQ9CSU0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms