Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gnpda2Q9CRC9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gnpda2Q9CRC9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms