Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CRC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CRC3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CRC3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CRC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CRC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms