Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NmbQ9CR53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NmbQ9CR53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms