Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Polr3kQ9CQZ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr3kQ9CQZ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr3kQ9CQZ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr3kQ9CQZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr3kQ9CQZ7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr3kQ9CQZ7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Polr3kQ9CQZ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms