Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rer1Q9CQU3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rer1Q9CQU3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms