Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT2

Rbm7, RNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm7Q9CQT2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm7Q9CQT2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm7Q9CQT2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms