Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim8Q9CQQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms