Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Snrpb2Q9CQI7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snrpb2Q9CQI7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpb2Q9CQI7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms