Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic3Q9CQE7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms