Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd2Q9CQ48 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudcd2Q9CQ48 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudcd2Q9CQ48 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms