Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp3Q9CQ10 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chmp3Q9CQ10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp3Q9CQ10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms