Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scd3Q99PL7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scd3Q99PL7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scd3Q99PL7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms