Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rims1Q99NE5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rims1Q99NE5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms