Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vgll1Q99NC0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll1Q99NC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms