Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cadm3Q99N28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cadm3Q99N28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms