Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cmtm3Q99LJ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms