Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Lims1Q99JW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lims1Q99JW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms