Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pacsin3Q99JB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms