Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf112Q96DY5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf112Q96DY5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf112Q96DY5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf112Q96DY5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms