Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SptssbQ925E8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms