Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prss28Q924N9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms