Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Letmd1Q924L1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Letmd1Q924L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms