Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Riok1Q922Q2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Riok1Q922Q2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms