Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Synpo2Q91YE8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms