Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usb1Q91W78 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usb1Q91W78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms