Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hps3Q91VB4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hps3Q91VB4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hps3Q91VB4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms