Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc115Q8VE99 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc115Q8VE99 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms