Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup35Q8R4R6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms