Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc12Q8R344 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc12Q8R344 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms