Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2aQ8R0A6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2aQ8R0A6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms