Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rnf183Q8QZS5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rnf183Q8QZS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rnf183Q8QZS5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rnf183Q8QZS5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf183Q8QZS5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf183Q8QZS5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf183Q8QZS5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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